三軍「司令」在2006年以前稱「總司令」，「司令部」也稱「總司令部」。如今少了個「總」字，除了咬文嚼字，最大的差異在哪裡呢？
早期「總司令」時代，三軍兵力由各軍種調度。那時打仗，海軍戰艦若需空軍戰機支援，典型的程序是：戰艦向海軍「台北作戰中心」(簡稱北戰)提出「空援」申請，北戰轉發給空軍作戰指揮中心；若空軍「總司令」同意，作戰中心才會下達命令至聯隊，最終由聯隊長派遣戰機執行任務。
不難想見，這種「各自為陣」的指揮體系早已不適合現今「三軍一體」、「分秒必爭」的戰場環境。因而自2006年，三軍「總司令」降格成「司令」，其中最重要的轉變就是國防部收回三軍總司令原擁有的「兵權」。如今三軍執行任務的兵力，例如海軍在航艦、空軍在空機，一律交由國防部「參謀本部」指揮。
如果在戰時，全國作戰指揮中心只有一個，那就是位於大直的衡山指揮所。
敦睦遠航是海軍年度例行任務，艦艇一旦納編支隊，指揮權便轉移到國防部參謀本部。這時海軍司令和支隊的關係，類似以下狀況：
張三是台大醫院名醫，因防疫需求納編到CDC，後來不幸因他的誤判造成社區感染。
這時除了處分張三，請問台大醫院的院長需要出面道歉嗎？
當然需要，因為張三畢竟來自於台大醫院――如果你同意這觀點，海軍司令如今就應為敦睦支隊防疫失敗而道歉。
不過，別忘了獎勵或處分的依據是「指揮鏈」――有權便有責，無權便無責――不管是軍中或民間，不都如此？
